La película es la adaptación de la serie de videojuegos de Nintendo, en ella se cuenta la historia de Mario y Luigi, dos hermanos que viajan a un mundo oculto para rescatar a la princesa Peach, capturada por el malvado rey Bowser.
Las cosas no serán sencillas, tendrán que ir enfrentándose a diferentes retos y obstáculos que los hermanos tendrán que superar para conseguir su objetivo.